C'est évidemment "différents" puisque l'adjectif s'applique aux trois mots, vous faites d'ailleurs bien l'accord en genre. A ce propos, pour éviter la petite gêne d'un nom féminin avec un adjectif au masculin, et dans la mesure du possible j'écrirais :
ayant une composition, une couleur et un diamètre différents