À ce sujet, j'aimerais signaler un phénomène curieux, bien que normal, et que je qualifierais de "disparition de la virgule doublée". Prenons un exemple :
Je crus d'abord à quelque boutade paradoxale, mais, l'ayant regardé, je remarquai la fixité de sa pupille [...].
Si l'incise "l'ayant regardé" n'existait pas, on aurait la phrase : « Je crus d'abord [...], mais je remarquai ... », avec virgule avant mais; la mise de l'incise entre virgules, grammaticalement indispensable, apporte une construction plus lourde, que je qualifie de construction "en virgule doublée".
Dans le même paragraphe, l'auteur écrit :
Je repris néanmoins mon journal mais, loin de penser à ce que je lisais, je me demandais avec angoisse pourquoi mon ami avait ce regard [...].
La virgule entre la principale et la coordonnée a disparu (devant le mais), au tout respect de la grammaire, puisqu'elle est facultative, [*] mais surtout en allégeant la phrase au profit de l'incise.
Je préfère, mais c'est affaire de choix.
[*] on a, ici aussi, disparition de la virgule doublée, laquelle serait impensable à écrire.